רצוי להגביל את השימוש במי פה ללא יותר משלוש פעמים ביום:
1. למי פה יש תכונות אנטיבקטריאליות מסוימות; עם זאת, שימוש תכוף וממושך עלול לשבש את פלורת החיידקים הרגילה של חלל הפה, מה שעלול להוביל לבעיות כגון כיבים בפה. לכן, מומלץ להגביל את השימוש ללא יותר משלוש פעמים ביום.
2. שטיפות פה מכילות לרוב מרכיבים כמו אלכוהול, כלורהקסידין ומי חמצן. שימוש תכוף וממושך עלול להוביל לירידה בחוש הטעם ולתחושת צריבה ברירית הפה; כתוצאה מכך, מומלץ להימנע משימוש-לטווח ארוך.
3. יש להשתמש במי פה מרשם אך ורק בהתאם להוראות המפורטות בעלון המוצר. באופן דומה, אין להשתמש במי פה ללא-מרשם לעתים קרובות או לתקופות ממושכות. לקבלת תוצאות מיטביות, עדיף להשתמש במוצרים אלה בהנחייתו של איש מקצוע רפואי.